Den øverste myndighed i Kvindernes Bygning er repræsentantskabet. Det består af de foreninger, som siden 1895 har været med i indsamlinger og siden 1936 har haft en tæt tilknytning til Kvindernes Bygning. Den organisatoriske udvikling kan følges i referater i henholdsvis de tidlige håndskrevne protokoller og de senere maskinskrevne/printede dokumenter.